DLA-geenien monimuotoisuuskartoitus vuonna 2011/2012 suomalaisessa basenjikannassa

Tiedote 16.9.2011
DLA-työryhmän puolesta,
Hanni Joronen, DLA-projektin vetäjä

DLA-työryhmään kuuluvat henkilöt
Satu Vuorio toimii DLA-työryhmän sihteerinä, Hanni Joronen projektin vetäjänä ja kolmas jäsen on jalostustoimikunnan puheenjohtaja Päivi Salomäki.

DLA-testin tarkoitus
Tarkoitus on kartoittaa mahdollisimman laajasti basenjikantamme DLA-monimuotoisuus teettämällä testi sitä tarjoavassa testilaboratoriossa Genoscoper Oy:ssä.
Tuloksena saadaan selvitys rodussa esiintyvistä haplotyypeistä sekä niiden frekvensseistä. Testin tulokset ovat julkisia ja tulokset julkaistaan kerhon internetsivuilla.

Projekti on käynnistetty virallisesti Suomen Basenjit ry:n hallituksen toimesta helmikuussa 2011:
- Lokakuussa 2010 yhdistyksen hallitus päätti, että yhdistys osallistuu DLA- kartoituksen kustannuksiin 1500 eurolla, edellytyksin, että noin 50 koiraa osallistuu testiin, tulos luovutetaan jalostustoimikunnan käyttöön ja yhdistyksen tukea saava koiran omistaja tai osaomistaja on yhdistyksen jäsen.
- Kerhon panostuksen lisäksi lisärahoitusta on hankittu match showlla sekä arpajaisilla.
- Kerhon tuki (1500e), sekä muut projektiin korvamerkityt rahat, jaetaan tasapuolisesti kaikkien tässä tutkimusryppäässä tutkittavien koirien kesken.
- Testiin on tähän mennessä ilmoittautunut n.50 koiraa.
- Projektiin otetaan mukaan kaikki omistajiensa toimesta ilmoitetut koirat.
- DLA-työryhmä on tehnyt listan koirista, joita pyydetään ilmoittautuneiden listan ulkopuolelta mukaan.
- Koirien omistajia kannustetaan otattamaan mielummin verinäyte koirastaan Lohen geenipankkiin tutkimusmateriaalin saamiseksi, kuin poskisolunäyte. Poskisolunäyte riittäisi todennäköisesti vain tähän tutkimukseen ja jatkotutkimusten osalta siitä ei olisi hyötyä.
- Mikäli koira osallistuu poskisolunäytteellä, löytyy testitikkujen tilaamiseen ja näytteen ottamiseen Genoscopen sivuilta ohjeet.
- Jalostustoimikunta on järjestänyt kesäpäivien yhteydessä joukkoverinäytteenoton.

Kokonaiskustannus
Kokonaiskustannus on Genoscoperilta saadun alkuperäisen tarjouksen mukaisesti seuraava: DLA-monimuotoisuustesti vähintään 50:lle basenjille hintaan 110€/koira (sis. ALV, ovh 130€).
Suomen Basenjit ry:lle syntyvät kustannukset ovat 1500e.
Työryhmässä työskentelevät henkilöt toimivat veloituksetta ja vastaavat itse mahdollisista yhteydenpitoon ym liittyvistä kuluista.

Mikrosatelliittimarkkerit
DLA-geeneillä on tärkeitä toimintoja elimistössä ja niiden monimuotosuuteen liittyy luonnollista valintaa. DLA-geenien testaaminen kertoo MHC-alueen monimuotoisuudesta ja saattaa heijastella koko rodun monimuotoisuuden tasoa. On kuitenkin huomattava, että koska DLA-geeneihin kohdistuu valintaa, ne saattavat säilyä monimuotoisempina kuin muut perimän alueet. Myös näiden muiden "neutraalimpien" MHC-geenialueen ulkopuolisten kromosomialueiden testaaminen (esimerkiksi polveutumismarkkereiden avulla) yhdessä DLA-geenien kanssa on hyödyllistä rodun monimuotoisuutta kartoitettaessa. Käytämme ”neutraalien” geenialueiden testaamiseen eri kromosomeissa sijaitsevia n. 20 toistojaksoihin perustuvaa mirkosatelliittimarkkeria. Näiden markkereiden monimuotoisuutta voidaan verrata MHC-geenien monimuotoisuuteen ja päätellä laajemmin koko perimän monimuotoisuutta ja verrata sitä muihin testattuihin rotuihin. Tämä antaa arvokasta tietoa rodun nykytilan toteamiseen ja tulevaisuuden jalostusohjelmien suunnitteluun. Kannattaa muistaa, että tehokas tapa monimuotoisuuden ylläpitämiseen perimän eri alueilla, mukaan lukien MHC-geenialue, on sisäsiittoisuuden vähentäminen.

Testin hinta
- Labran hinnat ovat siis entisenlaiset DLA-testaus 110e/koira (sis ALV) , jos osallistujakoiria on vähintään 50.
- Mikrosateliittitestaus DLA-testin hinnan päälle 40e/koira (sis ALV).
- Kerhon tuki on 1500e ja kerätyt rahat n900e jaetaan kaikkien osallistuvien koirien kesken.
- Summa/koira selviää ilmoittautumisajan loputtua. Jos koiria osallistuu 50kpl DLA-testi maksaa n.62e/koira, jos osallistujia on 70kpl hinta on noin 75e/koira jne... (lisäksi 40e/koira, jos haluaa mikrosateliittikartoituksen).

HUOM!
Nyt pitää selvittää projektiin _VARMASTI_ osallistuvat koirat. Foorumin ketjun lista on tallessa, mutta jokainen koira, joka varmasti osallistuu ilmoittautukoon vielä erikseen. Emme tiedä ko. listan perusteella koirien omistajia, saati omistajan yhteystietoja/laskutusosoitetta.

Ilmoittautuminen
ILMOITTAUTUMISET osoitteeseen monimuotoisuus.basenjit (at) gmail.com 15.10.2011 mennessä!
Laita viestiin:
1. koiran virallinen nimi,
2. laskun maksajan nimi, osoite ja TOIMINNASSA oleva sähköpostiosoite (maksutiedot tullaan lähettämään sähköpostitse)
3. maininta onko koirasta jo näyte Lohen geenipankissa. Jos näytettä ei vielä ole otettu, kerro mikä on suunnitelma näytteen ottamisen suhteen aikataulullisesti.
4. Mainitse myös haluatko koirastasi mikrosateliittitestauksen.


Testitulos
Analysointiraportti on yhdistyksen omaisuutta ja koirakohtaiset tulokset yhteenvetoineen julkaistaan sekä meidän nettisivuilla että lehdessä. Jos tuloksista ollaan kiinnostuneita Suomen rajojen ulkopuolella, voimme luovuttaa tietoja myös muille basenjikerhoille.

Lopuksi
Kun näytteitä lähetetään geenipankkiin, pitää lähetteeseen laittaa maininta, että näyte on menossa basenjien monimuotoisuuskartoitusprojektiin! Muutoin omistajalle lähtee lasku monimuotoisuuskartoituksesta täysimääräisenä.

Pitäkää myös KAIKKI huoli, että koiranne terveystiedot ovat ajantasalla geenipankissa ja että lupa-asiat ovat kunnossa ts. koiranne kohdalla on suostumus antaa tietoja rotujärjestölle. Tiedot voi päivittää osoitteeseen info@genoscoper.com